Modele etibox

L`un des grands avantages de ces ressources dans les modèles est la capacité d`effectuer des études approfondies des interactions plante – agent pathogène au niveau transcriptionnel. Par exemple, Thilmony et coll. (2006) ont commencé à démêler la manipulation de la transcription de l`hôte au cours de l`infection par l`Arabidopsis avec la souche infectieuse de Pseudomonas DC3000, en plus d`un mutant de Pseudomonas de l`hrpA (compromis dans sa capacité à délivrent des protéines effectrices de type III (Collmer et al., 2000) et du Pseudomonas DC3118 COR-mutant (défectueux dans la production de toxine coronatine). Cela leur a permis de commencer à séparer les changements transcriptionnels médiatisés par l`hôte de ceux causés par l`action d`effecteurs pathogènes et de facteurs de virulence. Ces études sont essentielles pour identifier les réponses transcriptionnelles «souhaitables» du point de vue de la plante hôte qui peuvent être utilisées dans les futures applications d`amélioration des cultures. Les modèles ont également permis d`effectuer des cours détaillés de temps d`infection, par exemple pendant l`infection à Phytophthora capsici de la tomate (jupe et al., 2013b) et Pendant l`infection à Botrytis cinerea d`Arabidopsis (Windram et al., 2012). Ces études ont donné une analyse détaillée de la reprogrammation transcriptionnelle au cours de la colonisation par un pathogène Hemi-biotrophique et nécrotrophique respectivement. La beauté de ces approches est qu`en plus de fournir des informations transcriptionnelles à haute résolution qui ont facilité le développement d`une pléthore d`outils bioinformatiques (Brown et al., 2013; Polanski et coll., 2014), il fournit des informations détaillées sur la chronologie de l`infection, permettant le regroupement de gènes exprimés de façon similaire. Ceci peut être utilisé pour la génération subséquente de modèles d`inférence de réseau (Penfold et Wild, 2011; Penfold et coll., 2012). Ces modèles permettent le développement d`hypothèses testables quant au rôle et à l`importance de gènes spécifiques dans les réseaux de régulation induits par le stress biotique. L`utilisation de modèles végétaux comme l`Arabidopsis et la tomate a joué un rôle déterminant dans le traitement des interactions plante – microbe. Les modèles ont particulièrement contribué à formuler des concepts pour décrire le système immunitaire des plantes (Jones et Dangl, 2006).

En raison de la large gamme d`agents pathogènes capables d`infecter ces deux plantes modèles, et leurs différents modes d`infection, la communauté scientifique a été en mesure de disséquer au niveau moléculaire le dialogue établi entre l`hôte et son pathogène et de comprendre ce qui se trouve la susceptibilité des plantes et la résistance aux maladies végétales. L`élucidation de la façon dont les protéines PRRs et R sont activées et déclencher la signalisation en aval pour répondre à la résistance a mis en évidence de nombreux acteurs clés à cibler pour une résistance accrue dans les plantes cultivées. Toutefois, le transfert global des connaissances de la recherche fondamentale vers les plantes cultivées a été plutôt limité (tableau 1). Il n`y a pas beaucoup d`exemples qui ont fait au niveau de la production commerciale et le progrès ici a été Disappointement lent Considérant combien nous avons appris sur l`immunité innée de plante ces dernières années. La caractérisation des réseaux de régulation des gènes de défense dans les usines modèles sera la prochaine étape qui accélère la transposition des connaissances en cultures. Les nouveaux outils d`approches de la biologie synthétique permettront aux sélectionneurs d`ingénieurs de concevoir des cultures de créateurs avec des défenses inductibles contre les agents pathogènes dépourvus des coûts de conditionnement physique correspondants qui pourraient les rendre peu attrayants pour les cultivateurs. Le futur défi pour la pathologie végétale sera de tirer parti de cette base de connaissances croissante dans les modèles pour concevoir une résistance durable dans les principales plantes cultivées pour maintenir le rendement face à l`altération des conditions climatiques.